Jsem ateista, nebo ne, nevěřím-li v Boha, ale v nadpřirozeno a duchy ano?

V podstatě záleží, jaký význam těm duchům přiznáváte. Pokud jen věříte, že nějací duchové existují, ale nemodlíte se k nim, ani je nijak neuctíváte, a zároveň ani nevěříte v nějakou vyšší – mocnější bytost, pak jste stále ještě ateista.
V momentě, kdy s těmi duchy nejen komunikujete, ale nějak je ctíte, uctíváte, předpokládáte, že řídí Váš život apod, pak už ateista nejste.

Ne.
Možná je na místě se zamyslet, proč věříš v toto a ne v Boha. Není to proto, že tyto nesmysly od tebe na rozdíl od Trojjediného Boha nic nevyžadují?

A Bůh není nadpřirozený?

Ateismus je v podstatě (ateisté mi snad prominou) jakási „víra“ (nebo přesvědčení) v neexistenci jakéhokoli duchovna, duchovních bytostí, Boha a podobně.

Pokud to srovnám s tím co píšete, jste někde uprostřed. Věříte tomu, že existuje cosi nadpřirozeného, duchovní bytosti, ale pro vás to není Bůh, ani andělé.

Jenže problém je v tom že duchové a nadpřirozeno souvisí z Bohem. Takže řekněme že jsi někde na půl cestě.